【相談】複数のサイトを開設する際に お願いします

似たジャンルのサイトを複数オープンしようと思っているのですが、まず１つドメインを取得して、その後それぞれサブドメインのみでの運用を考えてます。
その際、メインサイトなしの運用は何かデメリットありますでしょうか。
例えばメインサイトがすっからかんだとSEO的に良くないなど。

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